2001
ZRX1200R(A1)
2001年3月21日発売。ZRX1100のイメージをトレースしつつモデルチェンジ。ZRX1100をベースにボア×ストロークをアップし、鋳鉄ライナーから複合メッキシリンダー、凹形形状ピストンなどを新採用したエンジンを、1100と同形状の鋼管ダブルクレードルながら剛性をアップしたフレームに搭載。排出ガス浄化システムのKLEEN、KCA、パイプ触媒も新たに採用された。マルチリフレクターヘッドライト付きのハーフカウルをフレームマウントしたスポーツツーリングモデルZRX1200Sも新登場。
ZRX1200S(B1)
2002
ZRX1200R(A2)
2001年12月20日発売。ZRX1200Rは赤から前年のZRX1200Sよりも青味の強いキャンディーサンダーブルーに。ZRX1200Sは白っぽいイメージのシルバーベースにカラーを変更。ライムグリーンは変更なく継続。全車サイドカバーにKLEENのロゴが入った。
ZRX1200S(B2)
2003
ZRX1200R(A3)
2003年3月1日発売。1200では初となるブラック系カラーが新登場。青はカラー表記が変更になった。変更がないように見えるライムグリーンは、キャンディーカラーに変更。サイドカバーに入っていたKLEENのロゴは廃止された。